本所於民國八十一年成立，為國內首創跨領域整合衛生與福利兩大領域之研究所，目標在培育衛生福利政策、健康保險與福利政策等相關領域之人才。鑑於全民健保開辦與變革，面對高齡化的臺灣，未來我國無論在公部門與私部門對於能有效整合衛生與福利專業人才之需求必將殷切，有其前瞻性與迫切性，透過精心規劃整合衛生與福利之相關課程，期能掌握社會脈動，培育國家最需要之人才。本所博士班於民國95年開始招生。
本所為培育整合衛生政策與社會福利政策制定與管理之專才，引導學生對「衛生福利之組織與功能」和「衛生福利政策過程與決定因素 」能有充分的瞭解；同時藉由政策分析、規劃與評估的學科訓練，幫助學生具備「分析衛生福利政策之效率、效能及公平性」的能力，研發具有本土特色的衛生福利政策，以營造有益全民健康與福祉的大環境。
國立陽明交通大學衛生福利研究所 培養具有人文素養，社會關懷與國際視野的衛生福利政策專業人才 。發展衛生福利整合、政策倡導與實踐能力之專業領域、人才培育，服務社會。