本所一直保持公共政策、研究法(Ⅰ)、生物統計學或生物統計方法，共三科6學分為必修，課程份量紮實，是奠定本所碩士生踏進研究領域的重要奠基。因應學生背景來自醫療衛生及福利兩大領域，且老師不易延聘，故要求衛生領域必選社會福利學、社福領域必選公共衛生學。基本統計學和質性研究課程分別有(Ⅰ)(Ⅱ)階段，學生可學習更完整的觀念。
老師的專長配合學生的需要開課，給予學生最大的彈性，若本所學生有選課需要但本所未開設的課程，則可跨所、跨院、跨校選課。
實本所另設有暑期實習課程，讓同學們可以依據自身興趣及學習目標自行選擇前往中央健康保險署(醫務管理組、醫審及藥材組)、衛生福利部社會保險司(第七科、第八科)或臺北市長期照顧管理中心(各區服務站)等地方學習，以了解平常學術課程中較不易接觸到的實務經驗，並於學期初進行成果發表。(詳情請見【實習課程實施辦法】)
國立陽明交通大學衛生福利研究所 培養具有人文素養，社會關懷與國際視野的衛生福利政策專業人才 。發展衛生福利整合、政策倡導與實踐能力之專業領域、人才培育，服務社會。